办公室 （秘书处）
负责基金会的行政、人事、后勤、协调各部门综合 管理与服务的综合职能部门和办事机构，负责全球 NGO智库的组织建设。
基金项目孵化处
建立志愿者队伍，培养公益人才和项目，评估、孵化、赞助支持公益项目的发展和建设。
科研管理处
负责基金会科研管理工作和组织工作，负责基金会机构的审批、设立和管理考核等工作，表彰奖励对公益事业做出贡献的优秀公益组织及个人。
组织宣传处
负责基金会的组织建设和宣传工作，负责基金会的官方网站建设和资料编辑出版工作。
国际交流合作处
负责基金会外事接待和对外合作、交流等工作。
项目部
负责基金会项目及专项基金的设立、实施和管理等工作。
专家学术部
负责基金会重点学术交流的组织协调工作，指导基金会的学术活动，负责基金会相关出版物的业务指导工作，开展公益学术论坛讲座。
筹募与财务部
负责组织和开展基金会的公益资金筹募工作，接受社会各界公益捐赠和政府采购，负责基金会的财务、资金管理和使用工作。
投资管理委员会
按照国家法律法规及相关政策，策划、管理和组织实施基金会批准开展的各种慈善公益项目和投资项目，接受项目招标和项目申请并进行审核。
